台湾内務省の宗教業務課には、約30の宗教団体が登記されています。 宗教団体は、寺院管理法、市民団体法、あるいは民法の社団・財団に関する条項に従って、その全国組織を通じて中央当局に登記することができます。 2003年3月14日、台湾の内務省はその公認宗教団体名簿にサイエントロジー教会を追加しました。
「新しい宗教と見なされる申請者は、ただちにそれ独自の宗教上の教義、目的、教典、儀式、宗教組織の構造などの情報を、参考のために内務省に提出しなければなりません。 これにより、貴団体が全国的な宗教法人に格上げされることが承認されました。 以上により、貴団体は新しい宗教として
承認されたことが確定しました。」